من فائدة التسلسل الجيني او sequence genome ان نعمل المقارنة بين تتابعين او جينومين او اكثر كما تكلمت في تغريدات سابقة الان بتكلم عن طريقة عمل المقارنة بين تتابعين او اكثر بالتفصيل والخيارات اللي ممكن اعملها بداية في معلومة لازم تعرفها وهنا الحديث عن الجينوم (١) https://t.co/HKaMb5Tke0

اذا كانت نسبة التشابه اكثر من ٧٠٪ نقدر نستنتج ان الجينوم الجديد مأخوذ من الاول ، مثال لما نأخذ جينوم سارس ١ ونضع تحته جينوم #فيروس_كورونا بيظهر معي التشابه اكثر من ٧٠ ٪ ،طبعا فيه مواقع وبرامج كثيرة تقدم خدمة المقارنة بين التتابعات ويسمى المقارنة بين اثنين Pairwise aligment(٢) https://t.co/2CdDpS6LH6

واذا كانت اكثر من تتابعين تسمى multiple sequence نستطيع ببساطة عمل المقارنة اضع التتابع الاول ثم اضع التتابع الثاني تحته كيف؟ بداية انا بختار هالموقع https://t.co/yUJr6wBNEr هنا عندي خيارين ١/اني اضع تتابع وهو يبحث في قواعد البيانات الخاصة فيهم ويضع الاقرب في التشابه Blast(٣) https://t.co/ByZqBSyhoK

٢/اني اضع اكثر من تتابع اثنين او اكثر وتظهر لي مدى التشابه Clustal Omega،نبدأ برقم واحد المفترض هنا الجين عندي جاهز وفيه تغريدات البرايمر تكلمت عن طريقة نسخ الجين،ومثالنا بيكون جين S ل #فيروس_كورونا طبعا من الخيارات اني اقدر احفظ التسلسل الجيني بملف Word وارفعه على الموقع(٤)

نبدأ Blast وراح الصق التسلسل الجيني واضغط عند Submit،ننتظر (يفضل لاب توب اوكمبيوتر شخصي)وتطلع النتايج،الان ظهرت معي النتايج نلاحظ في شي اسمهSource المصدر ،وبجنبه ID ولو ضغطت عليه بينقلين الى الجينوم المطابق، ايضا فيه نسبة التطابق او Identities وان كل مانزلنا تقل النسبةوبنلاحظ(٥) https://t.co/wOmXhidndP